Eine der Hauptaufgaben der Bioinformatik ist die Analyse informationstragender Sequenzen verschiedener Arten von Biomolekülen. Die mit molekularbiologischen und biochemischen Techniken gewonnenen Daten werden in Datenbanken organisiert und mit Hilfe von Methoden des Textvergleichs untersucht.
Die Schülerinnen und Schüler können durch Kenntnisse über Daten und Datenbankstrukturen zielgerichtete Abfragestrategien entwickeln und dadurch solche Datenbanken effektiv nutzen.
Quelle: Lehrplan Bioinformatik, LPH 02/2007, Landesinstitut für Schulentwicklung
Analyse von Nucleotidsequenzen für molekularbiologische Anwendungen
Kleiner Führerschein für Bioinformatik-Datenbanken (WIS)
Die Sequenzierung von Proteinen und Nukleinsäuren liefert in kurzer Zeit immense Daten. Um diese Datenflut sinnvoll erschließen zu können, werden Sequenzdatenbanken verwendet. Dieser Wegweiser führt in Struktur und Gebrauch von Sequenzdatenbanken ein. Quelle: Materialien der WIS-Initiative: Wissenschaft in die Schulen!
Online-Tool zur Erstellung von Restriktionskarten
Mit diesem online-Tool können DNA-Sequenzen bis maximal 300 Kilobasen geladen und mit verschienen Restrikionsenzymen "verdaut" werden. Ausgegeben wird eine Restriktionskarte oder alternativ ein Gelbild, auf dem die Restriktionsfragemente der Länge nach aufgetrennt dargestellt sind.
Online-Tool zur Genanalyse: ORF (Open Reading Frame) Finder, NCBI
Ein Online-Analysetool für Gensequenzen zum Suchen und Finden von ORFs (Offenen Leserahmen)